本院成立於民國112年8月22日，由原行政院環境保護署之「環境檢驗所」及「環境保護人員訓練所」整併組織改設而成。

本院除支持環境部及其他所屬機關相關環保政策，負責環境檢測業務、環保專業人員訓育與環境教育及認證業務外，更因應「氣候變遷」、「資源循環」等新興環境議題，辦理「氣候變遷」及「環境治理」相關科研，賡續執行「污染防治」、「環境風險」等環境技術之研究開發、淨零排放人才培育及整合國內環境研究資源，以建立環境研究合作網絡，成為「環境智庫」。