為提高毒性及關注化學物質運作廠場之管理及安全，化學物質管理署持續執行「毒物及化學物質運作暨流向勾稽查核計畫」，與地方環保機關合作瞭解並掌握轄內化學物質之運作情形，確實掌握化學物質流向及依規定用途運作。

在管理作法上，透過由運作申報系統進行上下游申報紀錄之勾稽查核，掌握毒性及關注化學物質之運作流向，同時盤點與追蹤運作異常之場家，現場執行稽查作業。另也逐年辦理毒性及關注化學物質後市場調查、輔導作業，除調查業者實際使用運作毒性及關注化學物質之情形，包含製程內容、設備元件、毒性及關注化學物質於製程過程之角色、反應情形、產品類型等，並協助業者完成製程污染流向圖繪製與管理。

此外，為協助推動轄內毒性或具危害性關注化學物質運送人自主管理，維持審驗合格之全球定位系統(Global Positioning System，簡稱GPS)正常操作，以確保毒性或具危害性關注化學物質運送安全及完整性，主要透過各直轄市及縣市環保機關根據系統勾稽篩出異常車輛名單進行查核，掌握車輛軌跡異常與業者實際運作關聯性並回報查核結果，針對情形嚴重者實施臨時審驗。